Als der Kampf weitergeht, sind die Power Rangers gezwungen, sich auf die Suche nach dem sagenumwobenen Meister-Ninja Ninjor zu machen. Ninjorte lehrt sie die Kunst der Ninja, gibt ihnen neue Kräfte und Fähigkeiten und tritt selbst dem Team bei. Unterstützt von ihren neuen Ninja Zords, sind die Superhelden bereit, den Kampf mit Lord Zeddand Rita aufzunehmen. Die Kräfte des Bösen werden auch verstärkt, als Rita s Bruder RitoRevoltound ihr Vater Master Vile auf dem Mond ankommen. Die dritte Staffel sieht auch den Abschied der geliebten Pink Ranger Kimberly. Um das Erbe weiterzuführen und die Rolle des Pink Ranger zu übernehmen, wird den Rangers eine Austauschstudentin aus Australien namens Kat zur Seite gestellt.

Rita Repulsa stwisted Familienmitglieder RitoRevoltoand Master Vile schließen sich mit Lord Zeddandand Rita, um ihren Plan, die Erde zu erobern zu erhöhen. Vom Weisen Ninjor die mystischen Künste der Ninja erlernend, kämpfen die Power Rangers mit magischen Kampfsportfähigkeiten gegen die größte Bedrohung ihres Lebens.