Der tapfere Dämonenjäger Allen Walker und seine Kameraden bleiben unerschütterlich in ihrem Bestreben, die verlorene Unschuld wiederzufinden, während sie die untoten Schergen der schrecklichsten Armee des Bösen erschlagen. Als der verräterische Millennium-Graf eine Verschiebung des Machtgleichgewichts wittert, ruft der böse Anführer der Akuma eine Bande von abtrünnigen Kriegern herbei, die den Schwarzen Orden in seinen Grundfesten erschüttern wird. Die Schlacht, die über das Schicksal der Menschheit entscheidet, hat begonnen. Sollte Walker versagen, wird Innocence für immer verloren sein.