Ein wachsendes Volk an intelligenten Affen, das unter der Führung von Caesar (Andy Serkis) im Wald lebt, wird von einer Menschenbande bedroht, die vor zehn Jahren einen vernichtenden Virus überlebt hat. Malcom und Ellie (Kerie Russell) erkennen, dass diese wie auch die Menschen nur das verteidigen wollen, was ihnen wichtig ist: ihre Heimat, ihre Familien und ihre Freiheit. Gemeinsam plädieren sie für gegenseitiges Verständnis und erwirken ein Friedensabkommen, welches jedoch nur von kurzer Dauer ist. Für Dreyfus (Gary Oldman) sind die Affen Schuld am Virus und damit die erklärten Feinde. Er findet zahlreiche Anhänger, die vor Gewalt nicht zurückschrecken. Eine letzte Auseinandersetzung scheint unausweichlich und es kommt zum Kampf, der die Vorherrschaft über die Erde endgültig entscheiden soll.