Kaito, Akiho und der Rest des Roboter-Forschungsclubs haben endlich ihren Traum vom Bau eines Riesenroboters verwirklicht, nur um festzustellen, dass sie noch eine Menge Arbeit vor sich haben. Während sie Pläne für ein neues Modell entwerfen, beginnen seltsame Dinge um sie herum zu geschehen. Ein Roboteraufstand richtet in Tokio Verwüstung an, eine netzwerkbasierte KI dringt in die reale Welt ein und die Kimijima-Berichte prophezeien eine bevorstehende Apokalypse.